Un peu de concret par rapport à l’article un peu pauvre :

Les pathogènes fonctionnent avec des sortent de connecteurs. Un virus, par exemple, a des connecteurs autour de lui qui servent à interagir. Une cellule cancéreuse aussi. C’est comme un amas de LEGO : les connecteurs ont des formes et il fait la bonne forme pour se connecter au bon connecteur.

Un médicament fonctionne en se collant à un connecteur ciblé (target). Il faut la bonne forme pour boucher un connecteur et l’empêcher d’agir, ou pour stimuler le connecteur et le faire agir.

https://toolbox.eupati.eu/resources/comment-agissent-les-medicaments-stimulation-et-inhibition/?lang=fr

Les formes, ce sont des protéines. Il faut imaginer un collier d’aimants avec du gros fil en nylon. Les aimants s’attirent, se repoussent, et le fil en nylon empêche de tout tordre à volonté. C’est tellement petit qu’on sait lire les perles l’une après l’autre, mais on ne sait pas regarder la forme que ça a. Il y a une configuration qui a une énergie minimale, il suffit de tester toutes les configurations, et par le calcul, on en déduit la forme. Mais c’est une grosse combinatoire, et ça demande une puissance de calcul énorme.

Depuis quelques années (2000 et plus), il y avait Folding-at-home https://fr.m.wikipedia.org/wiki/Folding@home

Mais pour intuiter le résultat d’un puzzle complexe avec des règles simples, c’est un exercice dans lequel l’IA est très bonne. Inventer de nouveaux colliers de molécules qui vont prendre la bonne forme, par exemple. Et c’est ça le fond de l’article.

On donne une nouvelle cible, et on demande à l’IA de comprendre la forme de cette cible, et de générer l’autre forme qui s’emboiterait, c’est à dire un médicament qui pourrait s’attaquer à cette cible.